Tak, potrzebna Ci oddzielna karta dźwiękowa - nawet ta zintegrowana wystarczy, jeśli normalnie używasz oddzielnej. Fraps nagrywa źródło w ustawieniach oznaczone jako główne. Rzecz w tym, że aby wtedy podczas grania słyszeć dźwięk z obu kart będziesz musiał zafundować sobie jakiś mikser lub sumator. Możesz próbować z przelotkami 2->1, ale jakość rezultatu będzie raczej nieakceptowalna, chyba że będzie to jakiś hi-end.

Co do jakości karty dokupowanej - i tak Skype ma taką jakość audio, że nie ma sensu wkładać w nią cokolwiek więcej niż minimum. Byleby nie szumiała (co może denerwować przy dłuższym użytkowaniu - szczególnie jak będziesz rozmawiał z wyłączoną grą).